3DS版の隠しステージ

・マジカント　　　　：ネスを使用可能にする(対戦を10回行う)
・プププランド　　　：カービィの最後の切り札を1回使う(トレーニングでも可)
・パックメイズ　　　：パックマンの最後の切りふだを1回使う(トレーニングでも可)
・メイドインワリオ　：ワリオを使用可能にする(対戦を30回行う)
・バルーンファイト　：対戦で「むらびと」を3回以上使う
・ミュートシティ　　：対戦で「キャプテン・ファルコン」で3回1位になる
・フラットゾーン2　 ：クリアゲッターのパネル1枚目をすべて開放してパネル2枚目を出した状態、かつMr.ゲーム＆ウォッチを使用可能にする(対戦を90回行う)